Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TP53BP1Q12888 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms