Protein–RNA interactions for Protein: Q12870

TCF15, Transcription factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF15Q12870 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCF15Q12870 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms