Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
STX4Q12846 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
STX4Q12846 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
STX4Q12846 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
STX4Q12846 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
STX4Q12846 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
STX4Q12846 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
STX4Q12846 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
STX4Q12846 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
STX4Q12846 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
STX4Q12846 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
STX4Q12846 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
STX4Q12846 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
STX4Q12846 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
STX4Q12846 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
STX4Q12846 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
STX4Q12846 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
STX4Q12846 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
STX4Q12846 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
STX4Q12846 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
STX4Q12846 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
STX4Q12846 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
STX4Q12846 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
STX4Q12846 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
STX4Q12846 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
STX4Q12846 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
STX4Q12846 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
STX4Q12846 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
STX4Q12846 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
STX4Q12846 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
STX4Q12846 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
STX4Q12846 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
STX4Q12846 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
STX4Q12846 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
STX4Q12846 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
STX4Q12846 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
STX4Q12846 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
STX4Q12846 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
STX4Q12846 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
STX4Q12846 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
STX4Q12846 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
STX4Q12846 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
STX4Q12846 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
STX4Q12846 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
STX4Q12846 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
STX4Q12846 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
STX4Q12846 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
STX4Q12846 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
STX4Q12846 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
STX4Q12846 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
STX4Q12846 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
STX4Q12846 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
STX4Q12846 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
STX4Q12846 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
STX4Q12846 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
STX4Q12846 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
STX4Q12846 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
STX4Q12846 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
STX4Q12846 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
STX4Q12846 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
STX4Q12846 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
STX4Q12846 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
STX4Q12846 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
STX4Q12846 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
STX4Q12846 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
STX4Q12846 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STX4Q12846 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STX4Q12846 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STX4Q12846 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STX4Q12846 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STX4Q12846 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STX4Q12846 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STX4Q12846 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STX4Q12846 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STX4Q12846 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STX4Q12846 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STX4Q12846 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STX4Q12846 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STX4Q12846 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STX4Q12846 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STX4Q12846 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STX4Q12846 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STX4Q12846 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STX4Q12846 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STX4Q12846 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STX4Q12846 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STX4Q12846 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STX4Q12846 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STX4Q12846 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STX4Q12846 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STX4Q12846 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STX4Q12846 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STX4Q12846 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STX4Q12846 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STX4Q12846 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STX4Q12846 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STX4Q12846 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
STX4Q12846 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STX4Q12846 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STX4Q12846 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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