Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP1B1Q10567 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP1B1Q10567 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP1B1Q10567 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP1B1Q10567 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP1B1Q10567 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP1B1Q10567 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP1B1Q10567 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP1B1Q10567 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP1B1Q10567 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP1B1Q10567 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP1B1Q10567 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP1B1Q10567 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP1B1Q10567 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP1B1Q10567 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP1B1Q10567 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP1B1Q10567 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP1B1Q10567 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
AP1B1Q10567 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP1B1Q10567 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP1B1Q10567 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP1B1Q10567 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP1B1Q10567 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP1B1Q10567 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP1B1Q10567 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP1B1Q10567 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP1B1Q10567 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP1B1Q10567 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP1B1Q10567 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP1B1Q10567 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
AP1B1Q10567 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP1B1Q10567 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP1B1Q10567 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP1B1Q10567 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP1B1Q10567 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP1B1Q10567 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AP1B1Q10567 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms