Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms