Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms