Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms