Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBQ06643 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBQ06643 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBQ06643 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBQ06643 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBQ06643 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBQ06643 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBQ06643 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBQ06643 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBQ06643 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBQ06643 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBQ06643 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBQ06643 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBQ06643 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBQ06643 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBQ06643 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBQ06643 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBQ06643 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBQ06643 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBQ06643 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBQ06643 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBQ06643 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBQ06643 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBQ06643 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBQ06643 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBQ06643 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBQ06643 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBQ06643 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBQ06643 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBQ06643 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBQ06643 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBQ06643 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBQ06643 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBQ06643 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBQ06643 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBQ06643 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBQ06643 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBQ06643 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBQ06643 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBQ06643 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBQ06643 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBQ06643 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBQ06643 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBQ06643 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBQ06643 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBQ06643 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBQ06643 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBQ06643 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBQ06643 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBQ06643 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBQ06643 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBQ06643 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBQ06643 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBQ06643 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBQ06643 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBQ06643 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBQ06643 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBQ06643 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBQ06643 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBQ06643 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBQ06643 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBQ06643 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBQ06643 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBQ06643 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBQ06643 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBQ06643 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBQ06643 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBQ06643 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBQ06643 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBQ06643 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBQ06643 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBQ06643 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBQ06643 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBQ06643 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBQ06643 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBQ06643 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBQ06643 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBQ06643 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBQ06643 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBQ06643 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBQ06643 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBQ06643 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBQ06643 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBQ06643 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBQ06643 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBQ06643 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBQ06643 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBQ06643 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBQ06643 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBQ06643 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBQ06643 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBQ06643 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBQ06643 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBQ06643 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBQ06643 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBQ06643 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBQ06643 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBQ06643 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBQ06643 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBQ06643 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms