Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms