Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms