Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms