Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms