Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms