Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms