Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms