Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK6Q00534 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms