Protein–RNA interactions for Protein: P78426

NKX6-1, Homeobox protein Nkx-6.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-1P78426 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX6-1P78426 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms