Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HBBP68871 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HBBP68871 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HBBP68871 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HBBP68871 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HBBP68871 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HBBP68871 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HBBP68871 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HBBP68871 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HBBP68871 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HBBP68871 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HBBP68871 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HBBP68871 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HBBP68871 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HBBP68871 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HBBP68871 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HBBP68871 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HBBP68871 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HBBP68871 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HBBP68871 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HBBP68871 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HBBP68871 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HBBP68871 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HBBP68871 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HBBP68871 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HBBP68871 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HBBP68871 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HBBP68871 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HBBP68871 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HBBP68871 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HBBP68871 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HBBP68871 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HBBP68871 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HBBP68871 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBBP68871 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBBP68871 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBBP68871 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBBP68871 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBBP68871 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBBP68871 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBBP68871 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBBP68871 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBBP68871 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBBP68871 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBBP68871 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBBP68871 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HBBP68871 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBBP68871 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBBP68871 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBBP68871 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBBP68871 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBBP68871 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBBP68871 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBBP68871 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBBP68871 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HBBP68871 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBBP68871 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBBP68871 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBBP68871 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms