Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA2P62736 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA2P62736 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA2P62736 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA2P62736 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA2P62736 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA2P62736 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA2P62736 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA2P62736 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA2P62736 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA2P62736 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA2P62736 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA2P62736 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA2P62736 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA2P62736 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA2P62736 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA2P62736 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA2P62736 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA2P62736 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms