Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NCS1P62166 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCS1P62166 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCS1P62166 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCS1P62166 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCS1P62166 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCS1P62166 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCS1P62166 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCS1P62166 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCS1P62166 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCS1P62166 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCS1P62166 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCS1P62166 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCS1P62166 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCS1P62166 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCS1P62166 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCS1P62166 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCS1P62166 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCS1P62166 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NCS1P62166 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCS1P62166 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCS1P62166 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NCS1P62166 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCS1P62166 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCS1P62166 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCS1P62166 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCS1P62166 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCS1P62166 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCS1P62166 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCS1P62166 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCS1P62166 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCS1P62166 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCS1P62166 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCS1P62166 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCS1P62166 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCS1P62166 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCS1P62166 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NCS1P62166 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCS1P62166 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCS1P62166 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCS1P62166 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCS1P62166 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCS1P62166 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCS1P62166 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCS1P62166 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NCS1P62166 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCS1P62166 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NCS1P62166 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCS1P62166 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCS1P62166 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCS1P62166 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCS1P62166 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCS1P62166 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCS1P62166 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCS1P62166 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCS1P62166 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NCS1P62166 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NCS1P62166 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NCS1P62166 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NCS1P62166 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NCS1P62166 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NCS1P62166 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NCS1P62166 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCS1P62166 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NCS1P62166 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCS1P62166 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCS1P62166 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCS1P62166 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NCS1P62166 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCS1P62166 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCS1P62166 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCS1P62166 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCS1P62166 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCS1P62166 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCS1P62166 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCS1P62166 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCS1P62166 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCS1P62166 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCS1P62166 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCS1P62166 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCS1P62166 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCS1P62166 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCS1P62166 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCS1P62166 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCS1P62166 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCS1P62166 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCS1P62166 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCS1P62166 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCS1P62166 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCS1P62166 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NCS1P62166 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCS1P62166 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCS1P62166 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCS1P62166 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCS1P62166 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCS1P62166 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCS1P62166 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCS1P62166 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCS1P62166 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NCS1P62166 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms