Protein–RNA interactions for Protein: P61587

RND3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND3P61587 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RND3P61587 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RND3P61587 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RND3P61587 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RND3P61587 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RND3P61587 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RND3P61587 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RND3P61587 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RND3P61587 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RND3P61587 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RND3P61587 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RND3P61587 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RND3P61587 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RND3P61587 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND3P61587 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND3P61587 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND3P61587 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND3P61587 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND3P61587 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND3P61587 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND3P61587 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND3P61587 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND3P61587 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND3P61587 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND3P61587 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND3P61587 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND3P61587 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RND3P61587 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND3P61587 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND3P61587 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RND3P61587 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND3P61587 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND3P61587 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND3P61587 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND3P61587 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND3P61587 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND3P61587 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND3P61587 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND3P61587 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND3P61587 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND3P61587 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND3P61587 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND3P61587 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND3P61587 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND3P61587 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND3P61587 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND3P61587 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND3P61587 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND3P61587 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND3P61587 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND3P61587 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND3P61587 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RND3P61587 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND3P61587 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND3P61587 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND3P61587 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND3P61587 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND3P61587 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND3P61587 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND3P61587 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND3P61587 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RND3P61587 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND3P61587 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND3P61587 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND3P61587 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RND3P61587 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND3P61587 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND3P61587 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND3P61587 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND3P61587 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND3P61587 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND3P61587 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND3P61587 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND3P61587 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND3P61587 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND3P61587 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND3P61587 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND3P61587 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND3P61587 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND3P61587 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND3P61587 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND3P61587 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND3P61587 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND3P61587 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND3P61587 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND3P61587 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND3P61587 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND3P61587 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND3P61587 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND3P61587 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND3P61587 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND3P61587 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND3P61587 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND3P61587 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND3P61587 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND3P61587 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND3P61587 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND3P61587 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND3P61587 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND3P61587 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms