Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SNAP25P60880 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SNAP25P60880 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SNAP25P60880 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNAP25P60880 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SNAP25P60880 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP25P60880 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP25P60880 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP25P60880 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP25P60880 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP25P60880 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP25P60880 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP25P60880 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNAP25P60880 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP25P60880 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP25P60880 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP25P60880 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP25P60880 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP25P60880 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms