Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP107P57740 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP107P57740 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP107P57740 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP107P57740 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP107P57740 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP107P57740 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP107P57740 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP107P57740 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP107P57740 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP107P57740 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP107P57740 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP107P57740 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP107P57740 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP107P57740 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP107P57740 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP107P57740 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP107P57740 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP107P57740 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP107P57740 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP107P57740 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP107P57740 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP107P57740 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP107P57740 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP107P57740 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP107P57740 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP107P57740 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP107P57740 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP107P57740 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP107P57740 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP107P57740 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP107P57740 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP107P57740 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP107P57740 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP107P57740 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP107P57740 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP107P57740 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP107P57740 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP107P57740 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP107P57740 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP107P57740 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP107P57740 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP107P57740 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP107P57740 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP107P57740 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP107P57740 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP107P57740 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP107P57740 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP107P57740 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP107P57740 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP107P57740 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP107P57740 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP107P57740 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP107P57740 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP107P57740 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP107P57740 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP107P57740 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP107P57740 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP107P57740 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP107P57740 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP107P57740 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP107P57740 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP107P57740 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP107P57740 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP107P57740 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP107P57740 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP107P57740 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP107P57740 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP107P57740 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP107P57740 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP107P57740 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP107P57740 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP107P57740 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP107P57740 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP107P57740 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP107P57740 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP107P57740 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP107P57740 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP107P57740 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP107P57740 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP107P57740 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP107P57740 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP107P57740 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP107P57740 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP107P57740 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP107P57740 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP107P57740 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP107P57740 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP107P57740 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP107P57740 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP107P57740 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP107P57740 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP107P57740 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP107P57740 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP107P57740 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP107P57740 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP107P57740 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP107P57740 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP107P57740 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP107P57740 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms