Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB25P57735 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB25P57735 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB25P57735 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB25P57735 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB25P57735 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB25P57735 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB25P57735 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB25P57735 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB25P57735 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB25P57735 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB25P57735 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB25P57735 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB25P57735 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB25P57735 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB25P57735 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB25P57735 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB25P57735 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB25P57735 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB25P57735 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB25P57735 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB25P57735 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB25P57735 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB25P57735 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB25P57735 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB25P57735 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB25P57735 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB25P57735 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB25P57735 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB25P57735 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB25P57735 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB25P57735 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB25P57735 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB25P57735 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB25P57735 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB25P57735 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB25P57735 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB25P57735 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB25P57735 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB25P57735 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB25P57735 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB25P57735 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB25P57735 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB25P57735 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB25P57735 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB25P57735 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB25P57735 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB25P57735 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB25P57735 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB25P57735 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB25P57735 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB25P57735 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB25P57735 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB25P57735 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB25P57735 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB25P57735 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms