Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV3P56539 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV3P56539 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV3P56539 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV3P56539 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV3P56539 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV3P56539 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV3P56539 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV3P56539 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV3P56539 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV3P56539 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV3P56539 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV3P56539 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV3P56539 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV3P56539 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV3P56539 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV3P56539 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV3P56539 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV3P56539 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV3P56539 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV3P56539 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV3P56539 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV3P56539 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV3P56539 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV3P56539 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV3P56539 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV3P56539 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV3P56539 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV3P56539 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV3P56539 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV3P56539 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV3P56539 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV3P56539 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV3P56539 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV3P56539 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV3P56539 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV3P56539 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV3P56539 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV3P56539 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV3P56539 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV3P56539 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV3P56539 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV3P56539 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV3P56539 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV3P56539 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV3P56539 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV3P56539 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV3P56539 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV3P56539 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV3P56539 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV3P56539 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV3P56539 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV3P56539 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV3P56539 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV3P56539 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV3P56539 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV3P56539 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV3P56539 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV3P56539 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV3P56539 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV3P56539 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV3P56539 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV3P56539 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV3P56539 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV3P56539 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV3P56539 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV3P56539 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV3P56539 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV3P56539 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV3P56539 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV3P56539 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV3P56539 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV3P56539 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV3P56539 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV3P56539 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV3P56539 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV3P56539 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV3P56539 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV3P56539 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV3P56539 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV3P56539 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV3P56539 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV3P56539 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV3P56539 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV3P56539 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV3P56539 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CAV3P56539 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV3P56539 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV3P56539 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV3P56539 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV3P56539 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV3P56539 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV3P56539 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV3P56539 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV3P56539 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV3P56539 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV3P56539 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV3P56539 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV3P56539 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAV3P56539 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms