Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms