Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD23AP54725 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms