Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBX2P52951 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBX2P52951 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GBX2P52951 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBX2P52951 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBX2P52951 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBX2P52951 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBX2P52951 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBX2P52951 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBX2P52951 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBX2P52951 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBX2P52951 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBX2P52951 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBX2P52951 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GBX2P52951 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GBX2P52951 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBX2P52951 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBX2P52951 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBX2P52951 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBX2P52951 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBX2P52951 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBX2P52951 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBX2P52951 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBX2P52951 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX2P52951 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX2P52951 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX2P52951 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX2P52951 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX2P52951 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX2P52951 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX2P52951 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX2P52951 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX2P52951 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX2P52951 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX2P52951 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX2P52951 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX2P52951 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX2P52951 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX2P52951 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX2P52951 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX2P52951 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX2P52951 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX2P52951 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX2P52951 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX2P52951 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX2P52951 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX2P52951 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX2P52951 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX2P52951 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX2P52951 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX2P52951 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX2P52951 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX2P52951 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX2P52951 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX2P52951 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX2P52951 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX2P52951 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX2P52951 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX2P52951 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX2P52951 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX2P52951 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX2P52951 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX2P52951 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX2P52951 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX2P52951 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX2P52951 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX2P52951 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX2P52951 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX2P52951 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX2P52951 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX2P52951 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX2P52951 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX2P52951 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX2P52951 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX2P52951 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX2P52951 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX2P52951 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX2P52951 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX2P52951 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX2P52951 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX2P52951 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX2P52951 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX2P52951 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX2P52951 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX2P52951 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX2P52951 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX2P52951 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX2P52951 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX2P52951 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX2P52951 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX2P52951 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX2P52951 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX2P52951 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX2P52951 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX2P52951 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX2P52951 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX2P52951 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX2P52951 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX2P52951 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX2P52951 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms