Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HK3P52790 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HK3P52790 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HK3P52790 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HK3P52790 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HK3P52790 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HK3P52790 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HK3P52790 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HK3P52790 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HK3P52790 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HK3P52790 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HK3P52790 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HK3P52790 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HK3P52790 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HK3P52790 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HK3P52790 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HK3P52790 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HK3P52790 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HK3P52790 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HK3P52790 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HK3P52790 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HK3P52790 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HK3P52790 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HK3P52790 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HK3P52790 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HK3P52790 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HK3P52790 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HK3P52790 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HK3P52790 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HK3P52790 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HK3P52790 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HK3P52790 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HK3P52790 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HK3P52790 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HK3P52790 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HK3P52790 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HK3P52790 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HK3P52790 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HK3P52790 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HK3P52790 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HK3P52790 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HK3P52790 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HK3P52790 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HK3P52790 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HK3P52790 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HK3P52790 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HK3P52790 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HK3P52790 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HK3P52790 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HK3P52790 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HK3P52790 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HK3P52790 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HK3P52790 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HK3P52790 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HK3P52790 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HK3P52790 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HK3P52790 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HK3P52790 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HK3P52790 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HK3P52790 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HK3P52790 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HK3P52790 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HK3P52790 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HK3P52790 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HK3P52790 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HK3P52790 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HK3P52790 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HK3P52790 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HK3P52790 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HK3P52790 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HK3P52790 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HK3P52790 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HK3P52790 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HK3P52790 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HK3P52790 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HK3P52790 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HK3P52790 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HK3P52790 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HK3P52790 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HK3P52790 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HK3P52790 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HK3P52790 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HK3P52790 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HK3P52790 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HK3P52790 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HK3P52790 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HK3P52790 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HK3P52790 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HK3P52790 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HK3P52790 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HK3P52790 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HK3P52790 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HK3P52790 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HK3P52790 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HK3P52790 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HK3P52790 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HK3P52790 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HK3P52790 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HK3P52790 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HK3P52790 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms