Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LUMP51884 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LUMP51884 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LUMP51884 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LUMP51884 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LUMP51884 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LUMP51884 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LUMP51884 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LUMP51884 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LUMP51884 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LUMP51884 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LUMP51884 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LUMP51884 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LUMP51884 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LUMP51884 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LUMP51884 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LUMP51884 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LUMP51884 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LUMP51884 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LUMP51884 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LUMP51884 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LUMP51884 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LUMP51884 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LUMP51884 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LUMP51884 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LUMP51884 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LUMP51884 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LUMP51884 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LUMP51884 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LUMP51884 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LUMP51884 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LUMP51884 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LUMP51884 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LUMP51884 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LUMP51884 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LUMP51884 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LUMP51884 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LUMP51884 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LUMP51884 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LUMP51884 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LUMP51884 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LUMP51884 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LUMP51884 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LUMP51884 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LUMP51884 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LUMP51884 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LUMP51884 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LUMP51884 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LUMP51884 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LUMP51884 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LUMP51884 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LUMP51884 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LUMP51884 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LUMP51884 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms