Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCAMP50895 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCAMP50895 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCAMP50895 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCAMP50895 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCAMP50895 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCAMP50895 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BCAMP50895 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCAMP50895 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCAMP50895 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCAMP50895 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCAMP50895 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCAMP50895 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCAMP50895 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCAMP50895 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCAMP50895 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCAMP50895 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCAMP50895 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCAMP50895 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCAMP50895 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCAMP50895 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCAMP50895 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCAMP50895 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCAMP50895 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCAMP50895 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCAMP50895 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCAMP50895 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCAMP50895 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCAMP50895 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCAMP50895 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCAMP50895 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCAMP50895 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCAMP50895 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCAMP50895 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCAMP50895 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCAMP50895 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCAMP50895 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCAMP50895 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCAMP50895 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCAMP50895 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAMP50895 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAMP50895 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAMP50895 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAMP50895 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAMP50895 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAMP50895 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAMP50895 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAMP50895 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAMP50895 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAMP50895 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAMP50895 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAMP50895 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAMP50895 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAMP50895 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAMP50895 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAMP50895 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAMP50895 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAMP50895 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAMP50895 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAMP50895 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAMP50895 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAMP50895 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAMP50895 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAMP50895 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAMP50895 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAMP50895 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAMP50895 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAMP50895 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAMP50895 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAMP50895 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAMP50895 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAMP50895 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAMP50895 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAMP50895 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAMP50895 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAMP50895 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAMP50895 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAMP50895 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAMP50895 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAMP50895 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAMP50895 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAMP50895 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAMP50895 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAMP50895 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAMP50895 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAMP50895 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCAMP50895 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCAMP50895 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCAMP50895 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCAMP50895 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCAMP50895 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCAMP50895 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCAMP50895 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCAMP50895 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCAMP50895 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCAMP50895 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCAMP50895 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCAMP50895 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCAMP50895 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCAMP50895 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms