Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms