Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLMP48507 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLMP48507 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLMP48507 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLMP48507 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLMP48507 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLMP48507 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLMP48507 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLMP48507 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLMP48507 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLMP48507 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLMP48507 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLMP48507 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLMP48507 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLMP48507 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLMP48507 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLMP48507 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLMP48507 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLMP48507 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLMP48507 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLMP48507 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLMP48507 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLMP48507 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLMP48507 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLMP48507 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLMP48507 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLMP48507 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLMP48507 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLMP48507 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLMP48507 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLMP48507 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLMP48507 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLMP48507 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLMP48507 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLMP48507 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLMP48507 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLMP48507 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLMP48507 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLMP48507 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLMP48507 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLMP48507 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLMP48507 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLMP48507 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLMP48507 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLMP48507 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLMP48507 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLMP48507 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLMP48507 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLMP48507 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLMP48507 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLMP48507 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLMP48507 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLMP48507 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLMP48507 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLMP48507 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLMP48507 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLMP48507 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLMP48507 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLMP48507 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLMP48507 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLMP48507 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLMP48507 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLMP48507 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLMP48507 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLMP48507 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLMP48507 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLMP48507 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLMP48507 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLMP48507 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLMP48507 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLMP48507 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLMP48507 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLMP48507 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLMP48507 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLMP48507 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLMP48507 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLMP48507 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLMP48507 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLMP48507 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLMP48507 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLMP48507 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLMP48507 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLMP48507 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLMP48507 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLMP48507 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLMP48507 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLMP48507 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLMP48507 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLMP48507 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLMP48507 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLMP48507 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLMP48507 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLMP48507 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLMP48507 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLMP48507 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLMP48507 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLMP48507 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLMP48507 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLMP48507 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLMP48507 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms