Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms