Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA4P43681 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms