Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCAMP43121 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCAMP43121 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCAMP43121 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCAMP43121 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCAMP43121 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCAMP43121 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCAMP43121 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCAMP43121 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCAMP43121 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCAMP43121 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCAMP43121 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCAMP43121 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MCAMP43121 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCAMP43121 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCAMP43121 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCAMP43121 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCAMP43121 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCAMP43121 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MCAMP43121 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCAMP43121 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCAMP43121 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCAMP43121 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCAMP43121 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCAMP43121 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCAMP43121 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCAMP43121 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCAMP43121 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCAMP43121 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCAMP43121 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MCAMP43121 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCAMP43121 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCAMP43121 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCAMP43121 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCAMP43121 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCAMP43121 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCAMP43121 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCAMP43121 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCAMP43121 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCAMP43121 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCAMP43121 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCAMP43121 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCAMP43121 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MCAMP43121 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCAMP43121 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCAMP43121 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCAMP43121 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCAMP43121 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCAMP43121 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCAMP43121 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCAMP43121 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCAMP43121 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCAMP43121 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCAMP43121 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCAMP43121 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCAMP43121 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCAMP43121 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MCAMP43121 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCAMP43121 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCAMP43121 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCAMP43121 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCAMP43121 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCAMP43121 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCAMP43121 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCAMP43121 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCAMP43121 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCAMP43121 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MCAMP43121 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCAMP43121 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCAMP43121 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCAMP43121 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCAMP43121 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCAMP43121 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCAMP43121 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MCAMP43121 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCAMP43121 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCAMP43121 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCAMP43121 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCAMP43121 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCAMP43121 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCAMP43121 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCAMP43121 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCAMP43121 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCAMP43121 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCAMP43121 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCAMP43121 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCAMP43121 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCAMP43121 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCAMP43121 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCAMP43121 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCAMP43121 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCAMP43121 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCAMP43121 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCAMP43121 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCAMP43121 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCAMP43121 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MCAMP43121 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCAMP43121 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCAMP43121 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCAMP43121 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms