Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms