Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms