Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPARGP37231 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPARGP37231 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPARGP37231 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPARGP37231 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPARGP37231 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPARGP37231 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPARGP37231 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPARGP37231 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPARGP37231 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPARGP37231 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPARGP37231 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPARGP37231 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPARGP37231 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPARGP37231 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPARGP37231 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPARGP37231 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPARGP37231 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPARGP37231 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPARGP37231 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPARGP37231 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPARGP37231 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPARGP37231 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPARGP37231 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPARGP37231 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PPARGP37231 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPARGP37231 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPARGP37231 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPARGP37231 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPARGP37231 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPARGP37231 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPARGP37231 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPARGP37231 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPARGP37231 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPARGP37231 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPARGP37231 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPARGP37231 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PPARGP37231 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPARGP37231 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPARGP37231 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPARGP37231 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPARGP37231 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PPARGP37231 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPARGP37231 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPARGP37231 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PPARGP37231 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPARGP37231 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPARGP37231 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPARGP37231 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPARGP37231 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPARGP37231 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPARGP37231 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPARGP37231 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPARGP37231 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPARGP37231 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPARGP37231 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPARGP37231 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPARGP37231 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPARGP37231 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PPARGP37231 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPARGP37231 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPARGP37231 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPARGP37231 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PPARGP37231 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPARGP37231 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPARGP37231 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPARGP37231 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPARGP37231 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPARGP37231 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPARGP37231 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPARGP37231 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPARGP37231 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPARGP37231 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPARGP37231 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPARGP37231 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPARGP37231 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPARGP37231 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPARGP37231 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPARGP37231 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPARGP37231 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPARGP37231 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPARGP37231 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPARGP37231 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPARGP37231 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PPARGP37231 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PPARGP37231 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPARGP37231 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPARGP37231 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPARGP37231 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPARGP37231 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPARGP37231 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPARGP37231 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPARGP37231 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPARGP37231 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPARGP37231 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPARGP37231 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPARGP37231 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPARGP37231 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPARGP37231 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPARGP37231 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms