Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP7BP35670 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP7BP35670 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms