Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPB2P35606 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPB2P35606 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPB2P35606 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPB2P35606 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPB2P35606 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPB2P35606 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPB2P35606 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
COPB2P35606 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPB2P35606 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPB2P35606 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPB2P35606 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
COPB2P35606 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPB2P35606 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPB2P35606 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPB2P35606 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPB2P35606 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPB2P35606 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPB2P35606 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
COPB2P35606 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPB2P35606 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPB2P35606 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPB2P35606 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPB2P35606 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPB2P35606 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPB2P35606 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPB2P35606 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPB2P35606 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPB2P35606 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
COPB2P35606 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
COPB2P35606 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPB2P35606 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPB2P35606 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
COPB2P35606 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPB2P35606 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPB2P35606 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPB2P35606 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPB2P35606 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPB2P35606 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
COPB2P35606 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPB2P35606 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPB2P35606 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPB2P35606 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPB2P35606 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPB2P35606 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPB2P35606 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPB2P35606 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPB2P35606 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPB2P35606 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPB2P35606 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPB2P35606 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPB2P35606 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPB2P35606 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPB2P35606 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
COPB2P35606 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPB2P35606 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPB2P35606 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPB2P35606 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPB2P35606 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPB2P35606 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPB2P35606 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPB2P35606 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPB2P35606 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPB2P35606 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPB2P35606 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPB2P35606 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPB2P35606 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPB2P35606 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPB2P35606 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPB2P35606 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPB2P35606 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPB2P35606 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPB2P35606 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPB2P35606 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPB2P35606 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
COPB2P35606 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
COPB2P35606 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPB2P35606 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
COPB2P35606 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPB2P35606 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPB2P35606 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPB2P35606 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
COPB2P35606 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPB2P35606 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPB2P35606 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPB2P35606 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPB2P35606 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPB2P35606 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPB2P35606 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPB2P35606 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPB2P35606 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPB2P35606 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPB2P35606 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPB2P35606 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPB2P35606 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPB2P35606 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPB2P35606 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPB2P35606 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPB2P35606 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPB2P35606 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms