Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX2P32243 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX2P32243 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX2P32243 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX2P32243 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX2P32243 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX2P32243 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX2P32243 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX2P32243 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX2P32243 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX2P32243 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX2P32243 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX2P32243 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX2P32243 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX2P32243 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX2P32243 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX2P32243 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX2P32243 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX2P32243 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX2P32243 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX2P32243 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX2P32243 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX2P32243 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX2P32243 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX2P32243 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX2P32243 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX2P32243 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX2P32243 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX2P32243 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX2P32243 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX2P32243 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX2P32243 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX2P32243 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX2P32243 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX2P32243 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX2P32243 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX2P32243 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX2P32243 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX2P32243 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX2P32243 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX2P32243 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX2P32243 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX2P32243 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX2P32243 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX2P32243 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX2P32243 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX2P32243 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX2P32243 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX2P32243 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX2P32243 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX2P32243 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX2P32243 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX2P32243 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX2P32243 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX2P32243 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX2P32243 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX2P32243 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX2P32243 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX2P32243 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX2P32243 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX2P32243 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX2P32243 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX2P32243 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX2P32243 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX2P32243 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX2P32243 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX2P32243 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX2P32243 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX2P32243 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX2P32243 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX2P32243 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX2P32243 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX2P32243 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX2P32243 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX2P32243 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX2P32243 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX2P32243 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX2P32243 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTX2P32243 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTX2P32243 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTX2P32243 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTX2P32243 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTX2P32243 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTX2P32243 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTX2P32243 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTX2P32243 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTX2P32243 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTX2P32243 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTX2P32243 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTX2P32243 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTX2P32243 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTX2P32243 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTX2P32243 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTX2P32243 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
OTX2P32243 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTX2P32243 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTX2P32243 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTX2P32243 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTX2P32243 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTX2P32243 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms