Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCKARP32238 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCKARP32238 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCKARP32238 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCKARP32238 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCKARP32238 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCKARP32238 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCKARP32238 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCKARP32238 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCKARP32238 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCKARP32238 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCKARP32238 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCKARP32238 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCKARP32238 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCKARP32238 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCKARP32238 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCKARP32238 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCKARP32238 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCKARP32238 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCKARP32238 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCKARP32238 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCKARP32238 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCKARP32238 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCKARP32238 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCKARP32238 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCKARP32238 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCKARP32238 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCKARP32238 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCKARP32238 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCKARP32238 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCKARP32238 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCKARP32238 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCKARP32238 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCKARP32238 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCKARP32238 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCKARP32238 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCKARP32238 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCKARP32238 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCKARP32238 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCKARP32238 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCKARP32238 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCKARP32238 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCKARP32238 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCKARP32238 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCKARP32238 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCKARP32238 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCKARP32238 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCKARP32238 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCKARP32238 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCKARP32238 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCKARP32238 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCKARP32238 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCKARP32238 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCKARP32238 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCKARP32238 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCKARP32238 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCKARP32238 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCKARP32238 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCKARP32238 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCKARP32238 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCKARP32238 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCKARP32238 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCKARP32238 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCKARP32238 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCKARP32238 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCKARP32238 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCKARP32238 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCKARP32238 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCKARP32238 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CCKARP32238 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CCKARP32238 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCKARP32238 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKARP32238 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKARP32238 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKARP32238 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKARP32238 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKARP32238 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKARP32238 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKARP32238 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKARP32238 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKARP32238 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKARP32238 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKARP32238 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKARP32238 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKARP32238 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKARP32238 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKARP32238 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKARP32238 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKARP32238 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKARP32238 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKARP32238 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKARP32238 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKARP32238 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKARP32238 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKARP32238 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKARP32238 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKARP32238 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKARP32238 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKARP32238 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKARP32238 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms