Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms