Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP1P29466 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP1P29466 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP1P29466 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP1P29466 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP1P29466 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP1P29466 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP1P29466 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP1P29466 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP1P29466 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP1P29466 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP1P29466 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP1P29466 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP1P29466 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP1P29466 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP1P29466 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP1P29466 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP1P29466 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP1P29466 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP1P29466 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP1P29466 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP1P29466 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP1P29466 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP1P29466 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP1P29466 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP1P29466 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP1P29466 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP1P29466 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP1P29466 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP1P29466 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP1P29466 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP1P29466 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP1P29466 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP1P29466 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP1P29466 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP1P29466 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP1P29466 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP1P29466 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP1P29466 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP1P29466 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP1P29466 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP1P29466 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP1P29466 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP1P29466 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP1P29466 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP1P29466 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CASP1P29466 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CASP1P29466 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CASP1P29466 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CASP1P29466 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP1P29466 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP1P29466 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP1P29466 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP1P29466 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP1P29466 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP1P29466 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP1P29466 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP1P29466 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP1P29466 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP1P29466 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP1P29466 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP1P29466 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP1P29466 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP1P29466 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP1P29466 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP1P29466 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP1P29466 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP1P29466 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP1P29466 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP1P29466 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP1P29466 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP1P29466 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP1P29466 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP1P29466 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP1P29466 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP1P29466 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP1P29466 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP1P29466 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP1P29466 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP1P29466 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP1P29466 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP1P29466 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP1P29466 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP1P29466 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP1P29466 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP1P29466 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP1P29466 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP1P29466 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP1P29466 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP1P29466 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP1P29466 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP1P29466 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP1P29466 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP1P29466 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP1P29466 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP1P29466 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP1P29466 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP1P29466 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP1P29466 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP1P29466 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms