Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD34P28906 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD34P28906 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD34P28906 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD34P28906 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD34P28906 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD34P28906 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD34P28906 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD34P28906 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CD34P28906 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD34P28906 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CD34P28906 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD34P28906 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD34P28906 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD34P28906 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD34P28906 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD34P28906 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD34P28906 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD34P28906 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD34P28906 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD34P28906 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD34P28906 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD34P28906 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD34P28906 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD34P28906 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD34P28906 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD34P28906 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD34P28906 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD34P28906 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD34P28906 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD34P28906 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD34P28906 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD34P28906 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD34P28906 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD34P28906 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD34P28906 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD34P28906 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD34P28906 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD34P28906 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD34P28906 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD34P28906 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD34P28906 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD34P28906 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD34P28906 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD34P28906 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD34P28906 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD34P28906 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD34P28906 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD34P28906 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD34P28906 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD34P28906 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD34P28906 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD34P28906 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD34P28906 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CD34P28906 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD34P28906 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CD34P28906 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD34P28906 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD34P28906 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms