Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD27P26842 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD27P26842 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CD27P26842 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD27P26842 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD27P26842 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD27P26842 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD27P26842 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD27P26842 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD27P26842 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CD27P26842 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CD27P26842 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD27P26842 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD27P26842 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CD27P26842 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD27P26842 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD27P26842 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD27P26842 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD27P26842 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD27P26842 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CD27P26842 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD27P26842 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD27P26842 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD27P26842 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD27P26842 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD27P26842 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD27P26842 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD27P26842 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CD27P26842 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CD27P26842 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD27P26842 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD27P26842 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD27P26842 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD27P26842 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD27P26842 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD27P26842 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD27P26842 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD27P26842 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD27P26842 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD27P26842 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD27P26842 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD27P26842 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD27P26842 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD27P26842 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD27P26842 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD27P26842 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD27P26842 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD27P26842 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD27P26842 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD27P26842 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD27P26842 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD27P26842 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD27P26842 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD27P26842 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD27P26842 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD27P26842 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD27P26842 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CD27P26842 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD27P26842 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD27P26842 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD27P26842 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD27P26842 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD27P26842 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD27P26842 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD27P26842 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD27P26842 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD27P26842 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD27P26842 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD27P26842 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD27P26842 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD27P26842 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD27P26842 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD27P26842 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD27P26842 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD27P26842 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD27P26842 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD27P26842 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD27P26842 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD27P26842 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CD27P26842 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD27P26842 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD27P26842 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD27P26842 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD27P26842 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD27P26842 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD27P26842 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD27P26842 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD27P26842 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CD27P26842 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD27P26842 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD27P26842 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD27P26842 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD27P26842 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD27P26842 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD27P26842 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD27P26842 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD27P26842 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD27P26842 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD27P26842 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD27P26842 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms