Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DNMT1P26358 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DNMT1P26358 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms