Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms