Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSSP25774 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSSP25774 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSSP25774 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSSP25774 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSSP25774 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSSP25774 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSSP25774 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSSP25774 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSSP25774 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSSP25774 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSSP25774 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSSP25774 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSSP25774 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSSP25774 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSSP25774 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSSP25774 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSSP25774 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSSP25774 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSSP25774 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSSP25774 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSSP25774 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSSP25774 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSSP25774 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSSP25774 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSSP25774 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSSP25774 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSSP25774 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSSP25774 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTSSP25774 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSSP25774 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSSP25774 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSSP25774 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSSP25774 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSSP25774 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSSP25774 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSSP25774 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSSP25774 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSSP25774 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSSP25774 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSSP25774 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSSP25774 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSSP25774 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSSP25774 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSSP25774 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSSP25774 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSSP25774 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSSP25774 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSSP25774 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSSP25774 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSSP25774 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSSP25774 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSSP25774 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSSP25774 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSSP25774 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSSP25774 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSSP25774 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSSP25774 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSSP25774 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSSP25774 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSSP25774 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSSP25774 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSSP25774 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSSP25774 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSSP25774 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSSP25774 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSSP25774 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSSP25774 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSSP25774 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSSP25774 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSSP25774 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSSP25774 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSSP25774 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSSP25774 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSSP25774 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSSP25774 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSSP25774 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSSP25774 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSSP25774 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSSP25774 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSSP25774 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSSP25774 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSSP25774 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSSP25774 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSSP25774 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSSP25774 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSSP25774 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSSP25774 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSSP25774 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSSP25774 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSSP25774 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSSP25774 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSSP25774 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSSP25774 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTSSP25774 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTSSP25774 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTSSP25774 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSSP25774 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSSP25774 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSSP25774 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms